MASALAH FONOLOGI
Pengkodan fonologi merujuk kepada sistematik antara huruf dengan bunyi. Secara ringkasnya, kanak-kanak disleksia lazimnya mengalami kesukaran membezakan antara 'paku' dengan 'pasu'. Mereka juga tidak dapat 'mendengar' rima akhir yang sama antara perkataan. Umpamanya, apabila ditanya apakah perkataan yang bunyi akhirannya sama dalam "Jack and Jill went up the hill", mereka akan menjawab, "Jack" dan "Jill".
Ini juga bermakna mereka keliru dan sukar membezakan harga sesuatu barang dalam bahasa Inggeris, samada fifty cents ataupun fifteen cents. Kesukaran ini bukanlah disebabkan oleh masalah pendengaran, sebaliknya berkait dengan pemprosesan maklumat dalam otak (Farrer, 1996).
Keprihatinan dan pengetahuan para guru berkaitan masalah kanak-kanak disleksia sangat penting dalam usaha membantu mereka belajar. Contoh, kanak-kanak itu perlu diberi tempat duduk paling hadapan dalam bilik darjah. Dengan cara ini, guru dapat memberi tumpuan dan memerhatikan kanak-kanak secara berterusan bagi memastikan arahan guru dapat diikuti oleh kanak-kanak tersebut.
MASALAH MENGINGAT PERKATAAN
Umumnya, kanak-kanak disleksia mempunyai kecerdasan normal. Kebanyakan mereka mempunyai IQ yang normal dan sebahagian daripada mereka mempunyai kesedaran luar biasa. Walau bagaimanapun, mereka bermasalah dalam mencari semula perkataan. Ini bermaksud apabila mereka ditanyakan suatu soalan, mereka tidak dapat menjawab secara spontan. Mereka juga sering didapati mengalami kesukaran mengingati nama rakan, malahan anggota keluarga dan merujuk individu tersebut sebagai 'kawan sekolah saya' atau 'budak perempuan itu'. Hal ini bermaksud mereka sukar mengingati fakta-fakta di sekolah apabila disoal guru.
Seorang kanak-kanak disleksia mungkin dapat menghuraikan 'proses penyebaran' dalam subjek sains dengan panjang lebar tetapi mengalami kepayahan menyenaraikan contoh tumbuhan yang menggunakan angin sebagai mekanisme penyebaran. Selain itu, kanak-kanak disleksia juga cenderung menjadi kaku dan membisu apabila ditanyakan soalan.
MASALAH PENYUSUNAN BERSIRI
Kajian menunjukkan kanak-kanak disleksia sukar menyusun sesuatu secara bersiri seperti susunan bulan dalam setahun, susunan hari dalam seminggu, susunan huruf serta nombor. Justeru, mereka menghadapi masalah menghafal sifir ataupun mengingat susunannya. Apabila ditanya secara spontan, "Berapakah nilai 4X6?", mereka terpaksa membaca sifir daripada awal sehingga sampai kepada nombor yang dikehendaki. Ini bermakna penyelesaian satu masalah matematik yang mudah memerlukan jangkamasa yang lama serta banyak tenaga serta usaha. Masalah yang sama berlaku dalam operasi pembahagian.
Selain itu, kanak-kanak dislekdia juga menghadapi masalah menentukan waktu ataupun membaca jam serta membuat kira-kira yang berkaitan dengan waktu. Contohnya, soalan seperti "35 minit sebelum pukul 2.25 tengahari adalah.." sangat mencabar keupayaan mereka.
Sebahagian kanak-kanak disleksia menghadapi masalah dengan pengiraan yang melibatkan wang, seperti mengira jumlah harga barang atau menentukan baki.
MASALAH INGATAN JANGKA PENDEK
Ingatan jangka pendek ataupun ingatan bekerja merujuk kepada stor di mana maklumat yang sedang digunakan disimpan. Kanak-kanak disleksia didapati menghadapi masalah memproses maklumat yang baru masuk dan pada masa sama mengambil maklumat dari stor ingatan jangka panjang.
Kesemua proses ini akan mengumpul maklumat di stor ingatan jangka pendek bagi digunakan pada masa itu. Maksud lain, kanak-kanak disleksia tiada keupayaan mengingat arahan yang bertimpa yang diberikan. Contohnya, dalam subjek lukisan, terdapat arahan seperti, "Lipat dua kadbod, potong di garisan tengah dan seterusnya". Apabila arahan itu melibatkan 5 langkah atau lebih, lazimnya kanak-kanak disleksia akan terus hilang punca. Ini menyebabkan kanak-kanak itu disangka tidak menumpukan perhatian.
Contoh di rumah, apabila kanak-kanak disleksia disuruh, "Kamu masuk ke dalam bilik, simpan beg, susun buku dan bawa keluar baju kotor," kanak-kanak disleksia pasti akan tertinggal atau terlupa sesuatu. Akibatnya kanak-kanak disleksia dianggap tidak mengikut arahan atau degil.
Masalah yang sama juga timbul apabila kanak-kanak disleksia berhadapan dengan soalan aneka pilihan. Bagi memilih jawapan tepat, kanak-kanak tersebut perlu 'memegang' satu soalan dan empat pilihan jawapan dalam stor ingatan bekerjanya dan ini menimbulkan masalah kepada kanak-kanak itu. Sehubungan tersebut, mereka didapati lebih berupaya menjawab dengan baik dalam soalan terbuka di mana mereka dapat berfikir dan menulis jawapan yang dikehendaki.
MASALAH KESEDARAN SINTAKS
Kesedaran sintaks atau sensitiviti pada tatabahasa merujuk kepada kebolehan memahami sintaks suatu bahasa. Masalah ini wujud pada kanak-kanak disleksia di mana mereka sukar memahami peraturan sintaks dalam bahasa. Contoh, perkataan bahasa Inggeris dan bahasa Melayu mempunyai peraturan sintaks berbeza, di mana frasa "car key" dalam bahasa Inggeris manakala dalam bahasa Malaysia disebut "kunci kereta". Kanak-kanak disleksia menghadapi masalah dengan bahasa keduanya apabila peraturan sintaksnya berbeza dalam bahasa pertama.